缺標準:數(shù)據(jù)質(zhì)量影響報告準確性
中國食品藥品檢定研究院副院長王佑春研究員用“五多”表示下一代基因測序技術(shù)走向標準化應(yīng)用的難處。“與傳統(tǒng)診斷技術(shù)相比,下一代基因測序技術(shù)檢測靶點多、通量高、數(shù)據(jù)量多、分析流程多、質(zhì)量控制參數(shù)多。”這意味著用“整齊劃一”要求每一個檢測程序是艱難的。
王佑春簡要解釋了測序技術(shù)的內(nèi)容:“下一代基因測序的診斷由實驗室操作和生物信息學(xué)分析組成,實驗操作部分包括核酸提取、靶序列擴增或捕獲,信息學(xué)分析包括讀取數(shù)據(jù)、過濾數(shù)據(jù)、拼接序列、比對解讀以及結(jié)果報告。”
由于測序的復(fù)雜性,對其質(zhì)量評價面臨著許多挑戰(zhàn)。此外,與傳統(tǒng)診斷技術(shù)相比,測序技術(shù)包括的生物信息學(xué)分析部分是此前所未有的,這要求建立新領(lǐng)域的標準,例如建立數(shù)字參考品,包括標準序列或由其組成的標準數(shù)據(jù)庫等。王佑春表示,“當建立標準進行引導(dǎo),企業(yè)才知道應(yīng)如何生產(chǎn)這樣的試劑,促進產(chǎn)業(yè)走向規(guī)范化。”
由于標準的缺失,目前我國在基因檢測的數(shù)據(jù)質(zhì)量上令人擔憂。楚文江此前與國內(nèi)生物企業(yè)洽談合作后表示,在數(shù)據(jù)質(zhì)量控制方面國內(nèi)做的還遠遠不夠。如果數(shù)據(jù)錯了,后期分析、結(jié)果都是在浪費時間。
業(yè)界有人認為,二代測序檢測容易分析難。楚文江表示,這在學(xué)術(shù)層面上是對的。但在應(yīng)用層面上,大家的分析方法基本相通,所用數(shù)據(jù)庫可以相互補充。在此基礎(chǔ)上,檢測數(shù)據(jù)質(zhì)量更加重要,它不僅是突破的差異點,也直接影響著后期報告的準確性。所謂“失之毫厘謬以千里”,其中的毫厘可能只是幾個堿基對的差異。
呼喚監(jiān)管:保障科學(xué)性項目最終勝出
“嚴格的監(jiān)管表面看起來似乎阻礙創(chuàng)新,但它可以保證真正具有科學(xué)性的項目最終勝出。”楚文江認為,中國的監(jiān)管和行業(yè)標準相對比較寬松,早期發(fā)展迅猛,但在一定的時期內(nèi)需要撥亂反正,要防止醫(yī)學(xué)創(chuàng)新被市場綁架。
據(jù)2015年底全國性的腫瘤二代測序?qū)嶒炇屹|(zhì)量評估報告結(jié)果顯示,其中55%的實驗室是不合格的,甚至22%的實驗室居然得到的是0分。而中國食品藥品檢定研究院最近做過的一項樣本封盲檢測顯示,國內(nèi)4家測序企業(yè)對于同樣的樣本給出的診斷結(jié)果并不一致。楚文江認為,目前中國的基因檢測還沒有成熟完整的質(zhì)量監(jiān)管體系,體現(xiàn)在數(shù)據(jù)的準確性上沒有保證。而美國則調(diào)動聯(lián)邦政府層面比如美國食品藥品監(jiān)督管理局和美國聯(lián)邦醫(yī)療保險和醫(yī)療救助服務(wù)中心,州政府層面比如各州公共衛(wèi)生部門,以及行業(yè)協(xié)會等進行多重質(zhì)量標準和監(jiān)管。
與楚文江的觀點相似,中國食品藥品檢定研究院劉東來等此前撰文梳理了美國對實驗室研發(fā)診斷試劑的監(jiān)管之路,文章指出,醫(yī)療機構(gòu)此前未能得到明確監(jiān)管,直接導(dǎo)致了基因檢測市場的種種亂象,既無法保障消費者或患者的切身利益,又無法真正地促進技術(shù)創(chuàng)新和行業(yè)發(fā)展。
監(jiān)管需要回答的問題包括:檢測者擁有什么的資質(zhì),采用什么樣的質(zhì)量標準,是否定期進行熟練測試等。楚文江認為,這些都是患者關(guān)注的問題。
2015年7月,衛(wèi)健委發(fā)布《測序技術(shù)的個體化醫(yī)學(xué)檢測應(yīng)用技術(shù)指南(試行)》等指南,旨在進一步規(guī)范對臨床實驗室進行基因檢測的管理。隨著近年來,醫(yī)療機構(gòu)逐步可以委托獨立設(shè)置的醫(yī)學(xué)檢驗實驗室、病理診斷中心、醫(yī)學(xué)影像診斷中心等提供第三方服務(wù),此類舉措在提升服務(wù)同質(zhì)化的同時也進一步考驗了政府部門的監(jiān)管能力和智慧。
越來越多的獨立實驗室和公司都在進行相關(guān)技術(shù)的研發(fā),這就導(dǎo)致了監(jiān)管范圍需要擴大。這也是美國此前面臨的問題。該如何應(yīng)對?對監(jiān)管者的考驗仍在繼續(xù)。
