從路線方面，國(guó)民黨的理想信念模糊，缺乏一套有別于民進(jìn)黨且有感召力的話語(yǔ)體系和政策論述，路線主張不清晰、不明確，本土派“藍(lán)皮綠骨”，繼承了李登輝的路線，與民進(jìn)黨政治主張相近。非本土派繼承了傳統(tǒng)的國(guó)民黨路線，接受“九二共識(shí)”、堅(jiān)持“中華民國(guó)”的“法統(tǒng)地位”。在黨主席的選舉中，圍繞路線問(wèn)題矛盾復(fù)雜、分歧嚴(yán)重、斗爭(zhēng)激烈，尤其是本土派更是將路線之爭(zhēng)作為權(quán)斗的工具，將原主席洪秀柱貼上“終極統(tǒng)一”的標(biāo)簽，刻意攻擊、大肆唱衰，打壓洪的選情，加劇了黨的路線分歧與斗爭(zhēng)。國(guó)民黨“立院”黨團(tuán)書(shū)記長(zhǎng)林為洲一針見(jiàn)血地指出，國(guó)民黨民調(diào)沒(méi)起色，關(guān)鍵在于黨內(nèi)黨代表、中央委員、中常委等選舉內(nèi)耗太久，讓各級(jí)民代疏于本業(yè)，選舉過(guò)程的負(fù)面形象更讓黨扣分。
困結(jié)整合艱困改革阻力大。激烈的權(quán)力斗爭(zhēng)及路線分歧，不易調(diào)和，使得黨的團(tuán)結(jié)整合極其艱困，嚴(yán)重影響、削弱黨的整體競(jìng)爭(zhēng)力、戰(zhàn)斗力，黨中央對(duì)全黨的凝聚力不足，洪秀柱擔(dān)任黨主席時(shí)被外界形容黨令出不了中央黨部；吳敦義接任后，黨內(nèi)的矛盾斗爭(zhēng)依舊，舊的問(wèn)題沒(méi)能很好解決，新的矛盾又接踵而至，團(tuán)結(jié)整合形勢(shì)復(fù)雜棘手，吳的表現(xiàn)不那么令人滿意，吳誓言振興國(guó)民黨、重返執(zhí)政，卻沒(méi)有能夠很好地整合、團(tuán)結(jié)全黨，個(gè)人形象、低迷氣勢(shì)無(wú)明顯改觀，9月民調(diào)反映，近60%的民眾不相信吳能帶領(lǐng)國(guó)民黨改革成功；中評(píng)智庫(kù)大數(shù)據(jù)中心報(bào)告顯示，吳的個(gè)人形象對(duì)青年世代仍缺乏吸引力。這些說(shuō)明吳上任后沒(méi)有展現(xiàn)出應(yīng)有的組織領(lǐng)導(dǎo)和團(tuán)結(jié)整合能力。
國(guó)民黨的衰敗，也使得黨內(nèi)改革的呼聲高漲，特別是黨主席選舉，各候選人都提出自己的改革理念和主張，吳敦義上臺(tái)后，也提出一系列改革措施。然改革的動(dòng)力有余深度不足，阻力重重，對(duì)改革的方向、領(lǐng)域、內(nèi)容分歧大，難以達(dá)成共識(shí)，矛盾復(fù)雜、斗爭(zhēng)激烈；世代斷層、青黃不接現(xiàn)象嚴(yán)重，新老交替成效不大，對(duì)年輕人缺乏吸引力；黨務(wù)改革雷聲大、雨點(diǎn)小，中央黨務(wù)結(jié)構(gòu)和選前沒(méi)有太大區(qū)別；黨產(chǎn)包袱仍重，任人宰割；加之主席領(lǐng)導(dǎo)權(quán)威不足，領(lǐng)導(dǎo)人變動(dòng)頻繁，改革的連續(xù)性難以保證。這些都嚴(yán)重制約國(guó)民黨的發(fā)展。
被動(dòng)挨打斗爭(zhēng)策略薄弱。國(guó)民黨在野已經(jīng)一年多，雖一再表示要做一個(gè)合格的在野黨，卻遠(yuǎn)遠(yuǎn)沒(méi)有達(dá)到，在野斗爭(zhēng)經(jīng)驗(yàn)和策略極其缺乏、薄弱，無(wú)法與過(guò)去在野的民進(jìn)黨相提并論，民進(jìn)黨在野時(shí)通過(guò)體制內(nèi)的“合法”抗?fàn)幒腕w制外的強(qiáng)大社會(huì)運(yùn)動(dòng)相結(jié)合，弄得國(guó)民黨焦頭爛額、極其被動(dòng)，施政舉步維艱?，F(xiàn)今，國(guó)民黨在野一年多，與民進(jìn)黨的身份來(lái)了個(gè)大調(diào)換，卻缺乏在野斗爭(zhēng)經(jīng)驗(yàn)，策略呆板、薄弱，沒(méi)有因身份的轉(zhuǎn)換而變得主動(dòng)，面對(duì)執(zhí)政的民進(jìn)黨，顯得束手無(wú)策，仍處處被動(dòng)挨打，遭民進(jìn)黨“抄家滅族”式追殺，處境艱困，吳敦義上臺(tái)伊始，即面臨黨工薪資發(fā)放難題。對(duì)執(zhí)政黨的監(jiān)督、制衡乏力，民進(jìn)黨欲通過(guò)的眾多法案幾乎是暢通無(wú)阻。國(guó)民黨與親民黨、新黨的關(guān)系不睦，雖有心修復(fù)，卻無(wú)明顯成效，常常成為政壇孤家寡人，十分被動(dòng)。
上述困境仍嚴(yán)重制約著國(guó)民黨的發(fā)展，阻礙其東山再起。
