“主流非主流之爭”吹響國民黨分裂的號角，在臺立法機(jī)構(gòu)則形成“新國民黨連線”與“集思早餐會”的代理人戰(zhàn)爭。

李登輝主政期間，國民黨內(nèi)訌不斷，新黨前身“新國民黨連線”成立。

“新國民黨連線”本省、外省各半，以趙少康、郁慕明、李勝峰、陳癸淼為首，個個能言善道且戰(zhàn)斗力十足；“集思會”則以地方派系為主，清一色本省籍，成員包括黃主文、陳哲男、吳梓、饒穎奇、紀(jì)政等，扮演挺李急先鋒，1992年“立委”選舉甚至高舉“臺灣國民黨”大旗，雖然得到國民黨中央的強(qiáng)力支持，結(jié)果卻非常不理想，多人高票落選，但無損他們在李登輝心目中的地位。

“集思會”要角后來多半投靠民進(jìn)黨，陳哲男被陳水扁延攬擔(dān)任臺北市民政局長、陳水扁辦公室副秘書長；黃主文成了“臺聯(lián)黨”主席，兒子黃適卓則參加民進(jìn)黨；紀(jì)政在“東奧公投”中扮演急先鋒，完全無視當(dāng)年她一手催生的中華臺北。

1992年“立委”選戰(zhàn)，最著名一役是澎湖“內(nèi)戰(zhàn)”，“新國民黨連線”的陳癸淼大戰(zhàn)“集思會”力挺的林炳坤，雙方展開焦土作戰(zhàn)，結(jié)果陳癸淼在黃復(fù)興黨部的力挺下勝出。選后李登輝展開報復(fù)，“非主流”頭號大將郝柏村的行政機(jī)構(gòu)負(fù)責(zé)人一職遭摘除。

“新國民黨連線”在“立委”選舉中大有斬獲，成為黨內(nèi)最強(qiáng)而有力的反對派，對李登輝而言有如芒刺在背，雙方關(guān)系愈來愈緊張。1993年，“新國民黨連線”集體出走成立新黨。

1994年臺北市長選舉，新黨推出有“政治金童”稱號的趙少康參選，國民黨則由李登輝門生黃大洲出馬，分裂的藍(lán)軍碰上團(tuán)結(jié)的民進(jìn)黨必敗無疑，陳水扁漁翁得利當(dāng)選市長，為6年后的政黨輪替埋下第一顆種子。

1995年“立委”選舉，新黨喊出三黨不過半，造成國民黨很大的壓力。國民黨不僅在臺立法機(jī)構(gòu)負(fù)責(zé)人改選中差一點(diǎn)翻船，臺行政機(jī)構(gòu)負(fù)責(zé)人的任命也非常不順利。當(dāng)年不像現(xiàn)在臺當(dāng)局領(lǐng)導(dǎo)人想提名誰就提名誰，還需要經(jīng)過臺立法機(jī)構(gòu)同意，李登輝認(rèn)為綁手綁腳，1996年當(dāng)選連任后啟動最大政治交易，用“凍省”交換民進(jìn)黨同意放棄立法機(jī)構(gòu)的閣揆同意權(quán)。

第三部曲 直選風(fēng)波 李登輝傾向民進(jìn)黨

1992年臺立法機(jī)構(gòu)全面改選，臺灣地區(qū)領(lǐng)導(dǎo)人如何產(chǎn)生，成為一個不得不解決的問題。國民黨一開始主張委任直選，方法類似美國的選舉人團(tuán)制度，由民眾選出選舉人團(tuán)，再由選舉人團(tuán)選出領(lǐng)導(dǎo)人。

馬英九、施啟揚(yáng)當(dāng)時銜命溝通宣揚(yáng)，沒想到李登輝有自己的盤算，在黨內(nèi)無人知情的情況下大轉(zhuǎn)彎，全面倒向民進(jìn)黨力挺的公民直選制。此議一出全黨嘩然，馬英九、施啟揚(yáng)立馬變豬八戒里外不是人，馬英九就自嘲說“我講的話你們還會相信嗎？”

李登輝被戲稱是一個半黨的黨主席，連民進(jìn)黨主席黃信介都恭維他英明，但這一個半究竟是一個國民黨半個民進(jìn)黨抑或一個民進(jìn)黨半個國民黨呢？或許大家仁智互見，至少“領(lǐng)導(dǎo)人直選”這件事是一個民進(jìn)黨、半個國民黨，民進(jìn)黨講的話他比較聽得進(jìn)去。