臺海網(wǎng)(微博)2月8日訊 據(jù)福建新聞網(wǎng)福州報道(記者 龍敏)福建農(nóng)林大學(xué)7日對外通報,已完成深圳香莢蘭基因組測序的全部工作。這標(biāo)志著香莢蘭成為國際上第一個完成測序的蘭科藤本植物,意味著人類將獲取第一個重要香料植物的基因組圖譜。
據(jù)了解,香莢蘭(Vanillasp。)為蘭科香莢蘭屬植物,又名香子蘭、香草蘭、香草、香蘭,是典型的熱帶雨林中的一種大型蘭科香料植物,并因其獨(dú)特而無法人工合成的香味,被廣泛應(yīng)用于食品、化妝品、煙草等行業(yè),被譽(yù)為“香料皇后”?,F(xiàn)今,香莢蘭已是僅次于藏紅花的世界第二昂貴香料,在美國市場上每公斤香莢蘭果莢高達(dá)90美元,而且前景廣闊,行情看漲。
福建農(nóng)林大學(xué)校長蘭思仁教授介紹,蘭科植物占全世界植物種類10%,是世界性的瀕危物種,是植物界最大和進(jìn)化程度最高的家族之一,是生物多樣性和進(jìn)化研究以及生物保護(hù)的“旗艦”和理想的模式類群,具有極高的科研、生態(tài)、觀賞、文化和藥用價值,是中國最珍貴的野生植物資源之一。
蘭思仁說,由于目前全球尚未有對香莢蘭進(jìn)行基因組測序及分析的成功案例,而其所在的香莢蘭亞科在基因組測序上也仍處于空白狀態(tài),福建農(nóng)林大學(xué)聯(lián)合國家蘭科植物種質(zhì)資源保護(hù)中心(深圳)于2014年7月啟動了“香莢蘭基因組項目”,計劃率先對深圳香莢蘭進(jìn)行全基因組測序和生物信息分析,同時對相關(guān)種類的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測序和分析。
國家蘭科植物種質(zhì)資源保護(hù)中心(深圳)主任劉仲健介紹,經(jīng)過雙方科研人員的共同努力和深入研究,目前已經(jīng)完成了深圳香莢蘭基因組測序工作;已經(jīng)獲得260Gb測序數(shù)據(jù),基因組大小約800Mb,測序深度為325X,組裝結(jié)果接近精細(xì)圖標(biāo)準(zhǔn),其中ScaffoldN50=288Kb,ContigN50=22Kb,基因數(shù)量約29000個,雜合度約1.14%,屬于高雜合復(fù)雜基因組。
國家林業(yè)局野生動植物保護(hù)與自然保護(hù)區(qū)管理司副司長劉亞文表示,項目的順利完成為揭示蘭科植物起源和系統(tǒng)演化研究奠定了重要基礎(chǔ),為香莢蘭保育研究工作和產(chǎn)業(yè)化提供新的突破口,有利于大力推進(jìn)香莢蘭乃至所有蘭科植物相關(guān)產(chǎn)業(yè)鏈的發(fā)展,對加強(qiáng)蘭科植物保護(hù)、蘭花品種創(chuàng)新和提升中國在生物學(xué)、生物多樣性等領(lǐng)域的研究水平具有重大的意義,也標(biāo)志著中國蘭科植物基因組測序技術(shù)的進(jìn)一步成熟。